Для определения рода слова “штольня” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “штольня” . Тогда в зависимости от окончания в слове “штольня” можно определить род.
Слово “штольня” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “штольня” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “штольня” находится по ссылке