Для определения рода слова “щиколотка” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “щиколотка” . Тогда в зависимости от окончания в слове “щиколотка” можно определить род.
Слово “щиколотка” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “щиколотка” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “щиколотка” находится по ссылке