Для определения рода слова “яга” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “яга” . Тогда в зависимости от окончания в слове “яга” можно определить род.
Слово “яга” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “яга” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “яга” находится по ссылке