Для определения рода слова “автотранспорт” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “автотранспорт” . Тогда в зависимости от окончания в слове “автотранспорт” можно определить род.
Слово “автотранспорт” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “автотранспорт” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “автотранспорт” находится по ссылке