Для определения рода слова “альма-матер” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “альма-матер” . Тогда в зависимости от окончания в слове “альма-матер” можно определить род.
Слово “альма-матер” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “альма-матер” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “альма-матер” находится по ссылке