Для определения рода слова “аммоний” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “аммоний” . Тогда в зависимости от окончания в слове “аммоний” можно определить род.
Слово “аммоний” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “аммоний” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “аммоний” находится по ссылке