Для определения рода слова “духовник” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “духовник” . Тогда в зависимости от окончания в слове “духовник” можно определить род.
Слово “духовник” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “духовник” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “духовник” находится по ссылке