Для определения рода слова “екатеринбург” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “екатеринбург” . Тогда в зависимости от окончания в слове “екатеринбург” можно определить род.
Слово “екатеринбург” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “екатеринбург” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “екатеринбург” находится по ссылке