Для определения рода слова “зародыш” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “зародыш” . Тогда в зависимости от окончания в слове “зародыш” можно определить род.
Слово “зародыш” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “зародыш” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “зародыш” находится по ссылке