Для определения рода слова “несовпадение” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “несовпадение” . Тогда в зависимости от окончания в слове “несовпадение” можно определить род.
Слово “несовпадение” употребляется в среднем роде (Потому как в начальной форме слова “несовпадение” окончание [е], [о]).Полный морфологический разбор Cуществительного “несовпадение” находится по ссылке