Для определения рода слова “нигилист” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “нигилист” . Тогда в зависимости от окончания в слове “нигилист” можно определить род.
Слово “нигилист” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “нигилист” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “нигилист” находится по ссылке