Для определения рода слова “таможня” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “таможня” . Тогда в зависимости от окончания в слове “таможня” можно определить род.
Слово “таможня” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “таможня” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “таможня” находится по ссылке