Для определения рода слова “кафе” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “кафе” . Тогда в зависимости от окончания в слове “кафе” можно определить род.
Слово “кафе” употребляется в среднем роде (Потому как в начальной форме слова “кафе” окончание [е], [о]).Полный морфологический разбор Cуществительного “кафе” находится по ссылке