Для определения рода слова “магистр” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “магистр” . Тогда в зависимости от окончания в слове “магистр” можно определить род.
Слово “магистр” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “магистр” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “магистр” находится по ссылке