Для определения рода слова “плоскостопие” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “плоскостопие” . Тогда в зависимости от окончания в слове “плоскостопие” можно определить род.
Слово “плоскостопие” употребляется в среднем роде (Потому как в начальной форме слова “плоскостопие” окончание [е], [о]).Полный морфологический разбор Cуществительного “плоскостопие” находится по ссылке