Для определения рода слова “подполковник” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “подполковник” . Тогда в зависимости от окончания в слове “подполковник” можно определить род.
Слово “подполковник” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “подполковник” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “подполковник” находится по ссылке