Для определения рода слова “пупырышек” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “пупырышек” . Тогда в зависимости от окончания в слове “пупырышек” можно определить род.
Слово “пупырышек” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “пупырышек” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “пупырышек” находится по ссылке