Для определения рода слова “секунда” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “секунда” . Тогда в зависимости от окончания в слове “секунда” можно определить род.
Слово “секунда” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “секунда” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “секунда” находится по ссылке