Для определения рода слова “ушкуй” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “ушкуй” . Тогда в зависимости от окончания в слове “ушкуй” можно определить род.
Слово “ушкуй” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “ушкуй” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “ушкуй” находится по ссылке