Для определения рода слова “фонендоскоп” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “фонендоскоп” . Тогда в зависимости от окончания в слове “фонендоскоп” можно определить род.
Слово “фонендоскоп” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “фонендоскоп” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “фонендоскоп” находится по ссылке