Для определения рода слова “икс” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “икс” . Тогда в зависимости от окончания в слове “икс” можно определить род.
Слово “икс” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “икс” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “икс” находится по ссылке