Для определения рода слова “кубышка” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “кубышка” . Тогда в зависимости от окончания в слове “кубышка” можно определить род.
Слово “кубышка” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “кубышка” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “кубышка” находится по ссылке