Для определения рода слова “недомогание” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “недомогание” . Тогда в зависимости от окончания в слове “недомогание” можно определить род.
Слово “недомогание” употребляется в среднем роде (Потому как в начальной форме слова “недомогание” окончание [е], [о]).Полный морфологический разбор Cуществительного “недомогание” находится по ссылке