Для определения рода слова “статс-секретарь” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “статс-секретарь” . Тогда в зависимости от окончания в слове “статс-секретарь” можно определить род.
Слово “статс-секретарь” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “статс-секретарь” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “статс-секретарь” находится по ссылке