Для определения рода слова “фармакопея” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “фармакопея” . Тогда в зависимости от окончания в слове “фармакопея” можно определить род.
Слово “фармакопея” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “фармакопея” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “фармакопея” находится по ссылке