Для определения рода слова “шкипер” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “шкипер” . Тогда в зависимости от окончания в слове “шкипер” можно определить род.
Слово “шкипер” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “шкипер” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “шкипер” находится по ссылке