Для определения рода слова “вафля” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “вафля” . Тогда в зависимости от окончания в слове “вафля” можно определить род.
Слово “вафля” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “вафля” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “вафля” находится по ссылке