Для определения рода слова “омут” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “омут” . Тогда в зависимости от окончания в слове “омут” можно определить род.
Слово “омут” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “омут” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “омут” находится по ссылке