Для определения рода слова “пагода” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “пагода” . Тогда в зависимости от окончания в слове “пагода” можно определить род.
Слово “пагода” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “пагода” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “пагода” находится по ссылке