Для определения рода слова “амеба” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “амеба” . Тогда в зависимости от окончания в слове “амеба” можно определить род.
Слово “амеба” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “амеба” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “амеба” находится по ссылке