Для определения рода слова “запеканка” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “запеканка” . Тогда в зависимости от окончания в слове “запеканка” можно определить род.
Слово “запеканка” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “запеканка” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “запеканка” находится по ссылке