Для определения рода слова “перпендикуляр” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “перпендикуляр” . Тогда в зависимости от окончания в слове “перпендикуляр” можно определить род.
Слово “перпендикуляр” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “перпендикуляр” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “перпендикуляр” находится по ссылке